أطلقت المراكز الأمريكية لمكافحة الأمراض والوقاية منها ، CDC ، كونسورتيومًا لبدء شبكة وطنية من مختبرات التسلسل التي ستسرع من إطلاق بيانات تسلسل SARS-CoV-2 في المجال العام. سيساعد الإصدار السريع لبيانات تسلسل الفيروسات التاجية المفتوحة في الإرشاد كوفيد-19 استجابة الصحة العامة ، ودفع الابتكار والاكتشاف ، وتعزيز فهم هذه الأوبئة والأوبئة المستقبلية.
هذه تسلسل SARS-CoV-2 للاستجابة لطوارئ الصحة العامة وعلم الأوبئة والمراقبة (SPHERES) كونسورتيوم ، والذي سوف يوسع بشكل كبير استخدام تسلسل الجينوم بأكمله (WGS) من فيروس COVID-19. سيوفر SPHERES بيانات تسلسل متسقة في الوقت الفعلي لفرق استجابة الصحة العامة التي تحقق في حالات ومجموعات COVID-19 في جميع أنحاء البلاد.
سيساعدهم هذا الاتحاد الجديد على فهم كيفية انتشار الفيروس بشكل أفضل ، على المستوى الوطني وفي مجتمعاتهم المحلية. ستساعد البيانات الأفضل ، بدورها ، مسؤولي الصحة العامة على قطع سلاسل الانتقال ، ومنع حالات المرض الجديدة ، وحماية الأرواح وإنقاذها.
"الولايات المتحدة هي الرائدة في العالم في مجال التسلسل الجينومي السريع المتقدم. ستلعب هذه الجهود المنسقة عبر مختبرات الصحة العامة العامة والخاصة والسريرية والأكاديمية دورًا حيويًا في فهم انتقال وتطور وعلاج SARS-CoV-2. أنا على ثقة من أن أفضل عقولنا وأكثرها مهارة تعمل معًا لمساعدتنا في إنقاذ الأرواح اليوم وغدًا "، قال مدير مركز السيطرة على الأمراض روبرت ريدفيلد ، العضو المنتدب
تتبع فيروس COVID-19 أثناء تطوره
يمكن أن تعطي بيانات التسلسل الجيني نظرة ثاقبة غير مسبوقة في بيولوجيا SARS-CoV-2 ، الفيروس الذي يسبب COVID-19 ، وتساعد في تحديد المشهد المتغير للوباء. من خلال تسلسل الفيروسات من جميع أنحاء الولايات المتحدة ، يمكن لمراكز السيطرة على الأمراض والوقاية منها وسلطات الصحة العامة الأخرى مراقبة التغييرات المهمة في الفيروس واستخدام هذه المعلومات لتوجيه تتبع جهات الاتصال ، وجهود التخفيف من آثار الصحة العامة ، واستراتيجيات مكافحة العدوى.
كونسورتيوم SPHERES هو جهد طموح لتنسيق تسلسل جينوم SARS-CoV-2 على المستوى الوطني ، وتنظيم عشرات الجهود الفردية الأصغر في شبكة واحدة وموزعة من المعامل والمؤسسات والشركات. يجمع الكونسورتيوم بين الخبرة والتكنولوجيا والموارد الخاصة بـ 40 إدارة صحة عامة حكومية ومحلية ، والعديد من المختبرات السريرية الكبيرة ، وأكثر من عشرين مؤسسة متعاونة عبر الحكومة الفيدرالية والأوساط الأكاديمية والقطاع الخاص.
ستؤسس SPHERES أفضل الممارسات ومعايير البيانات المتفق عليها ، وتسريع مشاركة البيانات المفتوحة ، وإنشاء مجموعة من الموارد والخبرات للمساعدة في جلب أحدث التقنيات للاستجابة الوطنية لـ COVID-19.
بيانات SPHERES مفتوحة ومشتركة
يشترك أعضاء الاتحاد في الالتزام بالمشاركة السريعة في التسلسل المفتوح. إنهم يخططون لإرسال جميع بيانات التسلسل المفيدة إلى المستودعات العامة في المركز الوطني لمعلومات التكنولوجيا الحيوية التابع للمكتبة الوطنية للطب (NLM / NCBI) ، والمبادرة العالمية لمشاركة بيانات إنفلونزا الطيور (GISAID) ، ومستودعات التسلسل العامة الأخرى. سيساعد هذا في ضمان أن بيانات التسلسل الفيروسي من جميع أنحاء الولايات المتحدة متاحة بسرعة لاتخاذ قرارات الصحة العامة ويمكن الوصول إليها مجانًا للباحثين في كل مكان.
يشمل أعضاء الاتحاد ما يلي:
الوكالات والمختبرات الاتحادية
مراكز السيطرة على الأمراض والوقاية منها ، مكتب الاكتشافات الجزيئية المتقدمة
مختبر أرجون الوطني
وكالة الصحة الدفاعية ، المعدية العالمية مرض مراقبة
الغذاء والدواء
مختبر لورانس بيركلي الوطني
مختبر لوس ألاموس الوطني
المعهد الوطني للحساسية والأمراض المعدية ، مكتب علم الجينوم والتكنولوجيا المتقدمة
المعهد الوطني للمعايير والتكنولوجيا
المكتبة الوطنية للطب المركز الوطني لمعلومات التكنولوجيا الحيوية
معهد والتر ريد للابحاث
مختبرات الصحة العامة الحكومية / المحلية
أريزونا
كاليفورنيا
ولاية ديلاوير
مقاطعة كولومبيا
فلوريدا
هاواي
مين
ميريلاند
ماساتشوستس
ميشيغان
مينيسوتا
نورث كارولينا
داكوتا الشمالية
نيفادا
نيو مكسيكو
نيويورك
يوتا
فرجينيا
واشنطن
ويسكونسن
وايومنغ
المؤسسات الأكاديمية
جامعة بايلور
جامعة كورنيل
مركز فريد هتشينسون لأبحاث السرطان
كلية طب جبل سيناء
جامعة نيويورك
جامعة شمال أريزونا
جامعة بافالو
جامعة كاليفورنيا، بيركلي
جامعة كاليفورنيا، ديفيس
جامعة كاليفورنيا في ايرفين
جامعة كاليفورنيا في لوس انجليس
جامعة كاليفورنيا في سان فرانسيسكو
جامعة كاليفورنيا في سانتا كروز
جامعة شيكاغو
جامعة ميريلاند
جامعة مينيسوتا
جامعة نبراسكا
جامعة نيو مكسيكو
جامعة واشنطن
جامعة ييل
الشركات
تشخيصات أبوت
BIOMERIEUX
الجينوميات الملونة
جينكو بيووركس
IDbyDNA
في-Q-أبيب
لابكورب
مخطوطة واحدة
تقنيات أكسفورد Nanopore
علوم المحيط الهادئ
QIAGEN
كويست دياغنوستيكش
علوم الحياة الحقيقية
يتم توفير أسماء الشركات لأغراض إعلامية فقط ، ولا يمثل إدراجها هنا مصادقة للشركات أو أي من منتجاتها أو خدماتها التجارية من قبل المراكز الأمريكية لمكافحة الأمراض والوقاية منها.
معاهد الصحة العامة أو البحوث غير الهادفة للربح
رابطة مختبرات الصحة العامة
مؤسسة بيل وميليندا غيتس
معهد واسع
تشان زوكربيرج BioHub
معهد كريج فينتر
تحالف الصحة العامة لعلم الأوبئة الجينومية
بحوث سكريبس
مختبر جاكسون
معهد بحوث الجينوميات متعدية - الشمال
مؤسسة والدر
على مدى السنوات الست الماضية ، استثمر مكتب برنامج الكشف الجزيئي المتقدم التابع لـ CDC في مختبرات الصحة العامة الفيدرالية والولائية لتوسيع استخدام الجينوميات الممرضة وغيرها من التقنيات المختبرية المتقدمة لمراقبة الأمراض المعدية والاستجابة لتفشي المرض. يهدف استثمار الكونسورتيوم الحالي إلى إنقاذ الأرواح في جائحة SARS-CoV-2 وإعداد الولايات المتحدة والعالم للاستجابة الوبائية في المستقبل.
لمعرفة المزيد حول التسلسل الجيني أو عمل CDC في الكشف الجزيئي المتقدم ، تفضل بزيارة https://www.cdc.gov/amd/
