تقدم Caris Life Sciences® النتائج التي توفر فهمًا أعمق لأن التعبير عن الجينات عن طريق الورم المرتبط بمدى التعرض للعقاقير ، مقسمًا حسب حالة p53 ، يرتبط بالنتائج السريرية على أنظمة العلاج الكيميائي الشائعة المستخدمة لعلاج سرطان القولون والمستقيم النقيلي (CRC). سيتم تقديم هذه النتائج في الاجتماع السنوي للجمعية الأمريكية لأبحاث السرطان (AACR) لعام 2022 الذي سيعقد في الفترة من 8 إلى 13 أبريل 2022 في نيو أورلينز ، لويزيانا.
البحث الذي يحمل ملصق بعنوان "التوقيعات الجينية التنبؤية والتنبؤية التي يسببها الدواء لمرضى سرطان القولون والمستقيم والمخصصة بناءً على حالة p53 والعلاج باستخدام FOLFOX أو 5-FU أو oxaliplatin أو irinotecan" (الملخص رقم 1231) ، بقيادة وفيق الديري ، دكتوراه في الطب ، دكتوراه ، FACP ، مدير مركز Legorreta للسرطان بجامعة براون ، عميد مشارك في كلية طب وارن ألبرت ، عضو في تحالف Caris 'Precision Oncology (POA). برنامج Caris 'POA هو عبارة عن شبكة متنامية من مراكز السرطان الرائدة في جميع أنحاء العالم والتي تتعاون لتعزيز الدقة في علم الأورام والأبحاث التي تعتمد على العلامات الحيوية. يتم تقديم هذا العمل في نيو أورلينز من قبل ليندسي كارلسن ، طالبة دراسات عليا في علم الأمراض في مختبر EL-DEIRY في براون.
كان الهدف من هذه الدراسة هو تحديد المؤشرات الحيوية التنبؤية للعلاجات الكيميائية المستخدمة في اتفاقية حقوق الطفل. استخدمت الدراسة خطوط خلايا CRC لتحديد الجينات المعبر عنها تفاضليًا بعد علاج 5-fluorouracil أو irinotecan أو oxaliplatin وطبقية التواقيع بناءً على حالة p53. من هذه الدراسات في المختبر ، قام الباحثون بعد ذلك بفحص ما إذا كانت هذه الجينات والتوقيعات الجينية يمكن أن تتنبأ بنتائج مرضى CRC بعد العلاج الكيميائي (FOLFOX ، 5-فلورويوراسيل ، إرينوتيكان أو أوكساليبلاتين). تم تحليل 2,983،6,229 عينة من المرضى من النوع البري و 53،XNUMX فقدان الوظيفة pXNUMX CRC بواسطة تسلسل الجيل التالي من DNA / RNA في Caris Life Sciences. تم استنتاج نتائج البقاء على قيد الحياة في العالم الحقيقي من بيانات مطالبات التأمين وتقديرات كابلان ماير. كان للتعبير الجيني النذير وغير النذير تأثير كبير على نتائج البقاء على قيد الحياة بعد علاجات دوائية محددة.
قال الديري: "تساعدنا هذه الدراسة على فهم أهمية التوقيعات الجينية في إظهار قدرة تنبؤية معززة مقارنة بالنصوص الفردية". "من خلال الربط بين البحوث الأساسية والسريرية ، يتيح لنا هذا البحث فهمًا أفضل للعلاجات التي من المرجح أن تفيد مرضى CRC." وجدت الدراسة أن تعبير الورم عن الجينات المرتبطة بالتعرض للعقاقير يمكن أن يتنبأ بالنتائج بعد العلاج الكيميائي:
• يتنبأ ارتفاع EGR1 و FOS mRNA بشكل مستقل بالاستجابة لـ FOLFOX في المرضى الذين يعانون من أورام p53 من النوع البري.
• يرتبط انخفاض CCNB1 mRNA بالتشخيص الجيد لمرضى CRC المصابين بأورام تحتوي على طفرات فقدان وظيفية لـ TP53.
• يتنبأ التعبير المنخفض عن BTG2 بتشخيص أفضل للمرضى المصابين بأورام متحولة MSI-High TP53.
• قد تُظهر التواقيع الجينية قدرة تنبؤية مُحسّنة مقارنةً بتأثيرات النسخ الفردية.
قال دبليو مايكل كورن ، كبير المسؤولين الطبيين في كاريس: "تركز Caris على المؤشرات الحيوية التي يمكن أن تتنبأ باستجابة المريض لأحدث العلاجات ، ولكنها أيضًا علاجات كيميائية مجربة وحقيقية مثل FOLFOX". "نحن متحمسون لرؤية قدرة البحث المترجمة مدعومة بالبيانات الهائلة متعددة الأقسام والأدوات التحليلية التي طورتها Caris وتواصل إحراز تقدم فيها."
يقوم التنميط الجزيئي الشامل لـ Caris بتقييم الإكسوم الكامل (DNA) ، والنسخة الكاملة (RNA) وتعبير البروتين ، مما يوفر موردًا لا مثيل له والمسار المثالي للمضي قدمًا لإجراء البحوث التحويلية لتسريع اكتشاف الاكتشاف والتشخيص والمراقبة واختيار العلاج وتطوير الأدوية لتحسين حالة الإنسان.
سيقدم Caris بيانات إضافية من الدراسات التي توضح الدور الحاسم للطب الدقيق والتنميط الجزيئي في علاج السرطان. سيتم توفير جميع العروض التقديمية عبر الإنترنت من خلال موقع Caris الإلكتروني اعتبارًا من 8 أبريل 2022.
تكشف العروض التقديمية الإضافية عن تأثير التنميط الجزيئي الشامل وإمكانية الإجراء الإكلينيكي
• التوصيف الشامل لتعديلات FGF / FGFR في سرطانات الثدي الغازية (الملخص رقم 5793) تعتبر إشارات FGFR أساسية لتكاثر الخلايا السرطانية والهجرة وتكوين الأوعية والبقاء على قيد الحياة. أصبحت تعديلات FGFR قابلة للتنفيذ سريريًا في عدد متزايد من أنواع السرطان. قيمت هذه الدراسة حدوث وتوصيف العديد من تغييرات FGF / FGFR في أكثر من 12,000 سرطان الثدي الغازية وسلطت الضوء على التغاير الهائل لتعديلات FGF / FGFR في مختلف الأنواع الفرعية النسيجية والجزيئية وكذلك المواقع النقيلية المختلفة لسرطان الثدي. علاوة على ذلك ، تم عرض ارتباطات تعديلات FGFR ومقاومة العلاجات في قاعدة بيانات سريرية كبيرة مع نتائج جزيئية متطابقة.
• الخصائص الجينومية والمناعية للأنواع الفرعية EGFR في سرطان الرئة ذو الخلايا غير الصغيرة (الملخص رقم 4119) في حين أن أورام NSCLC المتحولة في EGFR تقاوم بشكل عام مثبطات PD-1 / PD-L1 ، يمكن لمجموعة فرعية صغيرة من المرضى أن يكون لديهم استجابات دائمة . تظهر الأورام الطافرة EGFR تباينًا جزيئيًا كبيرًا ، ومع ذلك ، هناك نقص في الوضوح في الملامح الجينومية والمناعة للأنواع الفرعية لطفرة EGFR ، وقد يساعد توضيح ذلك في تحديد المرضى الذين يحتمل أن يستجيبوا للعلاجات القائمة على المناعة. بالاستفادة من البيانات الجزيئية متعددة الأوميات الناتجة عن تسلسل الجيل التالي للحمض النووي والحمض النووي الريبي على مجموعة كبيرة من أورام NSCLC ، تؤكد هذه الدراسة انخفاض المناعة المرتبطة بمعظم الأنواع الفرعية لطفرات EGFR التي تتجلى من خلال المؤشرات الحيوية بما في ذلك PD-L1 و TMB و CD8 + T تسلل الخلية ويكشف عن طفرات EGFR نادرة مرتبطة بملف مناعي موات قد يشير إلى الاستجابة للعلاج المناعي.
ما الذي يجب استخلاصه من هذه المقالة:
- This study evaluated the incidence and characterization of numerous FGF/FGFR alterations in over 12,000 invasive breast cancers and highlighted the tremendous heterogeneity of FGF/FGFR alterations in various histologic and molecular subtypes as well as different metastatic sites of breast cancer.
- Caris Life Sciences® is to present findings that provide a deeper understanding that tumor expression of genes related to extent of drug exposure, stratified by p53 status, is associated with clinical outcomes on the common chemotherapeutic regimens used to treat metastatic colorectal cancer (CRC).
- This work is being presented in New Orleans by Lindsey Carlsen, a Pathobiology graduate student in the EL-DEIRY Lab at Brown.
